Гидрофобное ядро моего белка + ДНК-белковый комплекс

Пояснения к изображению гидрофобного ядра

В гидрофобное ядро входит 756 атома (123 аминокислотных остатка), что составляет приблизительно 15 процентов от всего белка (в состав рассматриваемого белка входит 824 аминокислотных остатка или примерно 4944 атома).

Минимальное расстояние от остатка в центре до атомв, полностью покрывающих поверхность ядра, составляет 0,573 нм.

Размеры молекулы воды составляют 0,38 нм. Проведя измерения при помощи JMol, можно увидеть, что расстояния между соседними не связанными ковалентно атомами составляеют т 0,2 до 0,5 нм, то есть молекула воды (или другая частица) может поместиться между ними.

Пояснения к изображению ДНК-белок комплексу

Молекула ДНК является носителем наследственной информации, однако не способна к её реализации. Именно поэтому в клетке присутствуют специальные белки, способные узнавать и связываться с определенными последовательностями нуклеотидов.

Такие белки принимают участие в репарации и репликации ДНК, транскрипции РНК, регуляции экспрессии генов (вторичные мессенджеры, передающие сигнал в ядро), а также в сворачивании ДНК в компактную форму (белки, называемые гистонами).


© Борисов Евгений 2016