Практикум 13

На главную

Ссылка на проект JalView Для домена Peptidase S13, найденного в D-alanyl D-alanine carboxypeptidase с помощью сервиса Pfam было скачано seed выравнивание. Ссылка на seed выравнивание в формате fasta Для одного из блоков seed выравнивания было построено logo и консенсусная последоватлеьность, logo представлено на рис.1. Ссылка на консенсусную последовательность в формате fasta

Рис.1 . Logo одного из блоков.

Паттерны для блока

Сильный паттерн: [LMV]-[REHIS]-[AGL]-K-T-G-[TS]-[LM]-[TSKNQ]-[GANT]-[VIA]-[NSYIRV]-[SAN]-L-[ASVT]-G-[YVF] Число находок: 5
Слабый паттерн: [AILMV]-x(2)-[KHR]-[TS]-G-[TS]-[AILMV]-x(5)-[AILMV]-x-G-[AILMVFYW] Число находок: 43