Гидрофобные ядра в белке 1 (скрипт Cores).В белке было обнаружено одно большое гидрофобное ядро, насчитывающее 508 атомов. После выполнения скрипта видно, что на поверхности белка присутствуют гидрофобные участки. Предположительно они нужны для соприкосновения с другими гидрофобными молекулами, например, другими белками или липидами.Плотность упаковки атомов в гидрофобном ядре белка (скрипт Surrounding).1. Атомы, почти полностью закрывающие фенилаланин находятся на расстоянии не более 4 ангстрем от остатка.2. Характерное расстояние между атомами в белке - 3 ангстрема. На этом шаге появилось количество атомов, сильно превосходящее количество атомов предыдущих шагов. 3. Да, может. Ван-дер-Ваальсов радиус кислорода равен 0.14 атомных единиц (5,291772108(18)·10^(-11)), что гораздо меньше даже 1 ангстрема. Взаимодействие белка и ДНК (скрипт ProtDna).Белки, взаимодействующие с ДНК: гистоны, составляющие нуклеосомы вместе с ДНК, белки, метилирующие ДНК (метилтрансфераза), режущие её, реплицирующие (ДНК-полимераза), РНК-полимераза, обеспечивающая транскрипцию, транскрипционные факторы, регулирующие работу РНК-полимеразы, хеликазы, разрывающие водородные связи между цепочками нуклеотидов в молекуле ДНК и разрезающие её, белки, осуществляющие репарацию ДНК. В нашем случае, белок режет ДНК (эндонуклеаза). |
После того, как структура загрузится, надо нажать две кнопки:
1. Запустить скрипт: 2. Продолжить исполнение скрипта:
Text of the script for 1st task |
| Дата последнего обновления: 24.02.2015 |
| © Роман Кудрин |