Водородные связи между ДНК и белком.

Количество: 40.
Для чего нужны: чтобы белок не отлипал от ДНК.

Подвижность атомов в молекуле белка.

Атомы в спиралях менее подвижны, чем атомы из петель. А атомы, которые находятся далеко от остова подвижнее остовных. Самые подвижные - удалённые от остова атомы петель. См. таблицу 1.
Таблица 1 Максимальные расстояния между ЯМР-моделями атомов в белке.
Остаток Положение Максимальное расстояние между моделями удалённого от остова атома, нм Максимальное расстояние между моделями остованого атома, нм
[LYS]409:A Спираль 8.584912 2.158691
[ARG]389:A Спираль 9.389824 1.2399262
[MET]356:A Петля 17.810766 12.644184
[LYS]420:A Петля 20.422472 14.333577
[LYS]323:A Спираль 8.804242 2.5278766
[PHE]338:A Петля 33.114166 26.730263
После того, как структура загрузится, надо нажать две кнопки:

1. Запустить скрипт:

2. Продолжить исполнение скрипта:

Text of the Hbonds Text of the NMR

Jmol output: