Methionine aminopeptidase

На главную

Таблица 1. Идентификаторы белка в различных базах данных

База данных Идентификатор
UniprotKB B2KEJ9_ELUMP; AC: B2KEJ9
Uniref50 UniRef50_B5YG27
RefSeq WP_012415560
PDB -

Изменения в 55-ой записи Uniprot по сравнению с 1-ой:

  • + CC -!- FUNCTION: Removes the N-terminal methionine from nascent proteins. Комментарий: добавлено описание функции белка.
  • + CC -!- SIMILARITY: Belongs to the peptidase M24A family. Methionine Комментарий: определено семейство, к которому принадлежит белок.
  • + OC Bacteria; Elusimicrobia; Elusimicrobia; Elusimicrobiales; Комментарий: обновлена систематика бактерии
  • + RX PubMed=19270133; DOI=10.1128/AEM.02698-08;
    + RA Herlemann D.P.R., Geissinger O., Ikeda-Ohtsubo W., Kunin V., Sun H.,
    + RA Lapidus A., Hugenholtz P., Brune A.;
    + RT "Genomic analysis of 'Elusimicrobium minutum,' the first cultivated
    + RT representative of the phylum 'Elusimicrobia' (formerly termite group
    + RT 1).";
    + RL Appl. Environ. Microbiol. 75:2841-2849(2009). Комментарий: добавлена ссылка на публикацию о бактерии.
Дата создания 1 записи: 06.10.2008
Дата создания 55 записи: 11.03.2015

Различия между записями Uniprot гомологичных белков.

Основное отличие между гомологичными белками заключается в их длине, все остальные параметры у них одинаковы (за исключением, конечно, организмов), см. сравнительную таблицу . Гомологичным белкам не обязательно быть одной длины, так как реакции они катализируют обычно конкретных не очень большим участком своей цепи - активным центром.

Представление наличия пирролизина в последовательности белка.

Белок Dimethylamine methyltransferase MtbB1 из протеома метаногенной бактерии Methanosarcina mazei имеет в последовательности пирролизин. Это отражается в записи Uniprot следующими строчками:
CC -!- SEQUENCE CAUTION:
CC Sequence=AAM31746.1; Type=Erroneous termination; Positions=356; Note=Translated as Pyl.; Evidence={ECO:0000305};
CC Sequence=AAM31747.1; Type=Erroneous termination; Positions=356; Note=Translated as Pyl.; Evidence={ECO:0000305};
FT NON_STD 356 356 Pyrrolysine. {ECO:0000250}
То есть, дано указание на ложную терминацию транскрипции (пирролизин кодируется стоп-кодоном UAG) и в Features прописано наличие нестандартной аминокислоты.

Дата последнего обновления: 24.05.2015
© Роман Кудрин