Практикум 1

Рис. 1 Нуклеотиды и нуклеозиды, нарисованные в MarvinSketch. Атомы пронумерованы. Красным цветом отмечены атомы, образующие N-гликозидную связь. Ссылка на файл .

Рис. 2 Участок ДНК из презентации, нарисованный в MarvinSketch. Красным цветом отмечены атомы, образующие N-гликозидную связь. Нуклеотиды подписаны. Ссылка на файл

Дополнительное задание

Рис. 3 Каноническая пара CG. Наиболее устойчива за счёт 3-х водородных связей.

Рис. 4 Хугстиновская пара CG. Хугстин показал, что устойчива.

Рис. 5 Пара C и таутомера G. Образует 2 водородных связи. Однако в центре расположены электроотрицательные атомы, являющиеся акцепторами водородных связей, поэтому устойчивость связи сомнительна.

Рис. 6 CA-пара. Образует две связи, сахарофосфатные куски расположены удобно, поэтому пара, предположительно, устойчива.

Рис. 7 CC-пара. Образует две связи. Однако в центре расположены электроотрицательные атомы, являющиеся акцепторами водородных связей, поэтому устойчивость связи сомнительна.

Рис. 8 CT-пара. Образует две связи, поэтому, предположительно устойчива. Сахарофосфатные куски благоприятствуют.

Рис. 9 Пара C и таутомера T. Образует две связи. Однако в центре расположены электроотрицательные атомы, являющиеся акцепторами водородных связей, поэтому устойчивость связи сомнительна.

Рис. 10 Пара C и ещё одного таутомера T. Очень похожа на предыдущую пару.