Практикум 3
Переукоренение дерева в среднюю точку.
Переукоренение производилось с помощью программы retree из пакета PHYLIP.
Рис. 1. Филогенетическое дерево рибосомных белков L1 из разных организмов, построенное программой MEGA, использовавшей метод Neighbour Joining.
Рис. 2. То же дерево, укоренённое в среднюю точку.
Ветвь, в которую укоренено дерево не изменилась. Есть основания считать, что дерево укоренено верно: BRADU - единственная альфа-протеобактерия, в то время, как NEIMA и RALPJ - бета-протеобактерии, а все остальные - гамма-протеобактерии.