База данных Pfam.

Описание доменной структуры FDHF_ECOLI.

• Картинка с изображением доменной структуры а.к. последовательности белка FDHF_ECOLI:
  
  
• Описание доменов:
  
  

  Идентификатор Pfam	Сокращенное название	Полное название на русском языке	Положение домена в последовательности
  PF04879	Molybdop_Fe4S4	Fe4S4-домен молибдоптериноксидоредуктазы	1-54
  PF00384	Molybdopterin	Молибдоптериноксидоредуктаза	61-488
  PF01568	Molydop_binding	Молибдоптериндинуклеотид-связывающий домен	575-682

  
  
• Картинка с изображением положения доменов в 3D- структуре:
  
  
  1aa6 PDB

Описание семейства доменов, к которому относится Molybdop_Fe4S4 (PF04879)

• Fe4S4-домен молибдоптериноксидоредуктазы находится в числе доменов семейства редуктазы/дегидрогеназы,которое включает предшественники нитратредуктаз периплазматического пространства,а также альфа-цепи формиатдегидрогеназ.
  
  
• Встречаемость белков с доменом PF04879 в различных таксонах:
  
  

  Таксон	Количество белков с доменом PF04879
  Эукариоты	0
  Бактерии	334
  Археи	51

  
  
• После рассмотрения основных типов доменной архитектуры можно сказать следующее:
  • Всего 478 белков с доменом PF04879
    
  • Гораздо чаще домен PF04879 встречается в сочетании с другими доменами ( из всех 478 белков всего 13 содержат единственный домен PF04879 ) Очень часто доменом-спутником является PF00384 (Molybdopterin)
    
  • Дупликация данного домена не обнаружена
    
  • Случаи перестановое не найдены: в большинстве белков присутствуют 3 домена- Molybdop_Fe4S4 , Molybdopterin , Molydop_binding ,которые всегда следуют в указанном порядке.
    
  • Большинство найденных белков содержат более 700 аминокислотных остатков.Это,вероятно,связано именно с тем,что в этих белках присутствуют все 3 вышеуказанных домена.