Для анализа был взят Scorpion toxin-like domain (ID: Toxin_3, AC: PF00537, Pfam entry).
Этот домен встречается в нейротоксинах разных видов скорпионов, а также в растительных дефензинов.
| Информация | комментарии | |
|---|---|---|
| Выравнивание seed | Число последовательностей: 33; Число колонок: 64 |
|
| Максимальный достоверный блок, включающие ВСЕ последовательности (МДБ-all) | 28-32 | |
| 100% консервативные колонки в МДБ-all | 28:[C] 32:[C] |
|
| Максимальный достоверный блок, включающий НЕ ВСЕ последовательности. (МДБ-notAll) | 1-61 | |
| 100% консервативные колонки в МДБ-notAll | 1:[RK] 2:[D] 3:[AG] 4:[Y] 5:[I] 6:[AV] 11:[N] 12:[C] 14:[FY] 19:[C] 28:[C] 32:[C] 38:[AG] 43:[C] 45:[WLY] 46:[AGLV] 51:[HYWF] 54:[AG] 55:[C] 57:[C] 60:[L] 61:[P] |
|
| Участок выравнивания, в котором нет никаких достоверных подблоков, и потому маловероятно, что выравнивание на этом участке отражает ход эволюции. | 10-22 | Среди столбцов есть консервативный столбец 19:[C] |
Cсылка на проект: Jalview.
Окно МДБ-all: Максимальный достоверный блок, включающие ВСЕ последовательности (МДБ-all);
Окно MДБ-notall: Максимальный достоверный блок, включающий НЕ ВСЕ последовательности. (МДБ-notAll);
Окно НБ: Участок выравнивания, в котором нет никаких достоверных подблоков, и потому маловероятно, что выравнивание на этом участке отражает ход эволюции.