KEGG |
Назад |
Для работы был выбран белок IKKA_HUMAN, его идентификатор в KEGG: hsa.1147
Этот белок участвует в следующих сигнальных путях:
hsa04010 MAPK signaling pathway hsa04014 Ras signaling pathway hsa04062 Chemokine signaling pathway hsa04064 NF-kappa B signaling pathway hsa04068 FoxO signaling pathway hsa04151 PI3K-Akt signaling pathway hsa04210 Apoptosis hsa04380 Osteoclast differentiation hsa04620 Toll-like receptor signaling pathway hsa04621 NOD-like receptor signaling pathway hsa04622 RIG-I-like receptor signaling pathway hsa04623 Cytosolic DNA-sensing pathway hsa04660 T cell receptor signaling pathway hsa04662 B cell receptor signaling pathway hsa04668 TNF signaling pathway hsa04920 Adipocytokine signaling pathway hsa05120 Epithelial cell signaling in Helicobacter pylori infection hsa05131 Shigellosis hsa05142 Chagas disease (American trypanosomiasis) hsa05145 Toxoplasmosis hsa05160 Hepatitis C hsa05161 Hepatitis B hsa05162 Measles hsa05166 HTLV-I infection hsa05168 Herpes simplex infection hsa05169 Epstein-Barr virus infection hsa05200 Pathways in cancer hsa05212 Pancreatic cancer hsa05215 Prostate cancer hsa05220 Chronic myeloid leukemia hsa05221 Acute myeloid leukemia hsa05222 Small cell lung cancerНа фиг.1 показан hsa04064 — NF-kB сигнальный путь. NF-kB — фактор транскрипции, действующий при ряде стрессовых условий. Он повышает транскрипцию антиапоптотических генов (c-FLIP, Bcl-xL, c-IAP1, c-IAP2, XIAP), цитокинов (IL1,6,8; TNFa) и белков клеточной адгезии, привлекающих лейкоциты.
Фиг.1 — NF-kB сигнальный путь из БД Kegg. IKKa в красной рамочке.
#2
C помощью БД Kegg была найдена метаболическая связь между хоризматом и убихиноном (см.табл.1, фиг.2).
| Англ.название | Рус.название | ID вещества в KEGG | Брутто-формула | Cтруктура вещества |
| Ubiquinone | Убихинон | C00399 | C14H18O4(C5H8)n | n.gif) |
| Chorismate | Хоризмат | C00251 | C10H10O6 |  |
Табл.1 — данные об убихиноне и хоризмате из БД Kegg.
Фиг.2 — метаболический путь, связывающий хоризмат (красный) и убихинон (зелёный). Интермедиаты — жёлтые.
На фиг.2 показан путь, по которому хоризмат может быть преобразован в убихинон:
Chorismate (C00251)<=> 4-Hydroxybenzoate(C00156) => 4-Hydroxy-3-polyprenylbenzoate(C05848) => 3-Polyprenyl-4,5-dihydroxybenzoate(C17554) => 3-Polyprenyl-4-hydroxy-5-methoxybenzoate(C17559) => 2-Polyprenyl-6-methoxyphenol(C17552) => 2-Polyprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone(C17560) => 2-Polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone(C17561) => 2-Polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-methoxy-1,4-benzoquinone(C17562) => Ubiquinone (C00399)