D4 |
Назад |
#Cоздайте изображения для комплекса димера пуринового репрессора с ДНК 1QPZ
В этом задании было создано 4 иллюстрации в PyMol.
Псевдоскрипт для создания иллюстраций
contact.py — скрипт для поиска контактных поверхностей
phob.py — скрипт для перевода выдачи CluD в PyMol-псевдоскрипт
Рис.1 — димер 1QPZ: ДНК выделена оранжевым, белковые цепи — голубым и зелёным; непрозрачным показана область контакта между мономерами белка;
Рис.2 — оранжевым выделена ДНК; голубым и зелёным — участки белка вблизи ДНК; непрозрачным — поверхность контакта ДНК и димера белка;
Рис.3 — то же, что и на рис.3; ДНК представлена в sticks-модели
Рис.4 — то же, что и рис.1; атомы из гидрофобных кластеров (см.псевдоскрипт №2) на поверхности контакта выделены красным;