#Для 1DGK найдите границы доменов согласно различным классификациям
|
Границы домена в БД, АА |
|
Pfam |
SCOPe |
CATH |
ECOD |
| Hexokinase_1 |
21-219 |
16-222 |
54-222_446-463 |
16-222 |
| Hexokinase_2 |
224-459 |
223-465 |
16-53_223-445 |
223-465 |
| Hexokinase_1 |
469-667 |
466-670 |
513-670_894-913 |
466-670 |
| Hexokinase_2 |
673-907 |
671-913 |
481-512_671-892 |
671-913 |
Табл.1 — доменная структура 1DGK в разных базах данных.
Границы доменов 1DGK в базах данных Pfam, ECOD и исторически связанным с ним SCOPe практически идентичны. А вот в CATH те же домены разделены на несколько участков в
белке, и соответственно, заметно отличаются от таковых, например, в идейно близком SCOPe.
|