Построение и визуализация электронной плотности (ЭП) |
Назад |
Структура этого фермента содержится в PDB под идентификатором 1DGK. Заявленное разрешение структуры 2.8А при полнте данных 80%.
В программе pymol при помощи команды:
isomesh backbone1, 1dgk_map, 2, backbone, carve =2было получено изображение электронной плотности вокруг остова белка. (см.рис.1). В этой команде “2” – уровень срезки, а carve обозначает пространство вокруг выбранных атомов, внутри которого необходимо изобразить электронную плотность. Без указания carve отображается электронная плотность для всей ячейки.
 Рис.1 — остов гексокиназы, вписанный в электронную плотность. |
| Уровень подрезки |
0.5σ | 1σ | 1.5σ | 2σ |
| Arg69 | .png) |
.png) |
.png) |
.png) |
| Phe782 | .png) |
.png) |
.png) |
.png) |
| Cys813 | .png) |
.png) |
.png) |
.png) |