Главная | Семестры | Проекты | Заметки | О себе | Полезные ссылки |
1. Определите, в каких метаболических путях участвует ваш фермент.
Идентификатор белка, который рассматривался в предыдущем занятии, в KEGG: hsa:2820. Для него найден один метаболический путь:
hsa00564 Glycerophospholipid metabolism - Homo sapiens (human), метаболизм глицеролофосфолипидов
Его можно посмотреть по ссылке.
2. Найдите в KEGG структурные формулы заданных соединений
Перейдем по ссылкам: KEGG > KEGG2 > KEGG LIGAND. Английские названия для веществ: chorismate(хоризмат), ubiquinone(убихинон).
Название вещества | Идентификатор | Формула |
chorismate (хоризмат) | C00251 | |
ubiquinone (убихинон) | C00399 |
3. Найдите метаболический путь от одного заданного вещества к другому
Воспользуемся следующим путем:KEGG > KEGG PATHWAY > Search&Color Pathway.
Рис.1. Биосинтез убихинона и других терпеноидных хинонов
Выбранная цепочка ферментативных реакций
Карта: Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis (биосинтез убихинона и других терпеноидных хинонов)
Путь: хоризмат-> убихинон
На рис.2. представлен выделенны метаболический путь.
Рис.2. Метаболический путь от хоризмата к убихинону.Начальное соединение выделено красным цветом, конечное – зелёным, промежуточные – жёлтым.