Белки

Главная Семестры Проекты Заметки О себе Полезные ссылки


1. Определите, в каких метаболических путях участвует ваш фермент.

Идентификатор белка, который рассматривался в предыдущем занятии, в KEGG: hsa:2820. Для него найден один метаболический путь:
hsa00564 Glycerophospholipid metabolism - Homo sapiens (human), метаболизм глицеролофосфолипидов
Его можно посмотреть по ссылке.

2. Найдите в KEGG структурные формулы заданных соединений

Перейдем по ссылкам: KEGG > KEGG2 > KEGG LIGAND. Английские названия для веществ: chorismate(хоризмат), ubiquinone(убихинон).

Название вещества Идентификатор Формула
chorismate (хоризмат) C00251
ubiquinone (убихинон) C00399


3. Найдите метаболический путь от одного заданного вещества к другому

Воспользуемся следующим путем:KEGG > KEGG PATHWAY > Search&Color Pathway.

Рис.1. Биосинтез убихинона и других терпеноидных хинонов

Выбранная цепочка ферментативных реакций
Карта: Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis (биосинтез убихинона и других терпеноидных хинонов)
Путь: хоризмат-> убихинон
На рис.2. представлен выделенны метаболический путь.



Рис.2. Метаболический путь от хоризмата к убихинону.Начальное соединение выделено красным цветом, конечное – зелёным, промежуточные – жёлтым.