Семейство белков:
IS200 похожие транпозазы.
Информация о белковом семействе.
В таблице 1 указаны основные сведения о выбранном белковом семействе.
| Информация | |
|---|---|
| AC pfam | PF01797 |
| ID pfam | Y1_Tnp |
| #SEED | 77 |
| #All | 10539 |
| #SW | 4 |
| #architectures | 282 |
| #3D | 16 |
| Taxonomy | |
| #eukaryota | 0 |
| #archaea | 2073 |
| #bacteria | 51847 |
| #viruses | 68 |
Выравнивание последовательностей.
Из базы данных Pfam были скачаны и загружены в JalView выровненные последовательности для выбранного семейства белков. Информация о найденных блоках представлена в таблице 2.
| Информация | Комментарии | |
|---|---|---|
| Выравнивание seed | 77 последовательностей | |
| Максимальный достоверный блок, включающий ВСЕ последовательности. (МДБ-all) |
Колонки 8-16 | В JalView: max_d_block |
| 100% консервативные колонки в МДБ-all |
Колонки 8 (H) и 16 (R) | Колонки найдены при помощи окрашивания выравнивания Clustal и заданной идентичности в 100 процентов. |
| Максимальный достоверный блок, включающий НЕ ВСЕ последовательности. (МДБ-notAll) |
73 последовательности; Колонки 66-92 |
В JalView: not_all_max_block |
| 100% консервативные колонки в МДБ-notAll |
Колонка 67 | |
| Участок выравнивания, в котором нет никаких достоверных подблоков, и потому маловероятно, что выравнивание на этом участке отражает ход эволюции. |
Колонки 27-39 | В JalView: non_evolution |