Филогенетическое дерево

Построение филогенетического дерева для выбранных актинобактерий.

Название	Мнемоника
Mycobacterium leprae	MYCLE
Corynebacterium diphtheriae	CORDI
Corynebacterium efficiens	COREF
Mycobacterium tuberculosis	MYCTU
Nocardioides sp.	NOCSJ
Mycolicibacterium vanbaalenii	MYCVP
Thermobifida fusca	THEFY
Streptomyces avermitilis	STRAW

Скобочная формула:(((STRAW,THEFY),NOCSJ),((MYCLE,MYCTU),MYCVP)),(CORDI,COREF))

Дерерво содержит следующие нетривиальные ветви:

{COREF,CORDI} против {NOCSJ,STRAW,THEFY,MYCLE,MUCTU,MYCVP}

{MYCLE,MUCTU} против {NOCSJ,STRAW,THEFY,MYCVP,COREF,CORDI}

{MYCLE,MUCTU,MYCVP} против {NOCSJ,STRAW,THEFY,COREF,CORDI}

{NOCSJ,THEFY,STRAW} против {MYCLE,MUCTU,MYCVP,COREF,CORDI}

{THEFY,STRAW} против {NOCSJ,MYCLE,MUCTU,MYCVP,COREF,CORDI}

Алгоритмы филогенетической реконструкции

С помщью сервиса NCBI Taxonomy были определены следующие таксономические категории:

COREF - Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium

CORDI - Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium

MYCLE - Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium

MYCTU - Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium; Mycobacterium tuberculosis complex

MYCVP - Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycolicibacterium

NOCSJ - Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Propionibacteriales; Nocardioidaceae; Nocardioides; unclassified Nocardioides

THEFY - Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Streptosporangiales; Nocardiopsaceae; Thermobifida

STRAW - Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Kitasatosporales; Streptomycetaceae; Streptomyces

{COREF,CORDI} - семейство Corynebacteriaceae

{MYCLE,MUCTU,MYCVP} - семейство Mycobacteriaceae