Описание пространственной структуры белка ENO_ECOLI по данным банка PDB, код 1e9i

Белок ENO_ECOLI состоит из четырёх цепей: A, B, C и D. Диаметр каждой цепи — примерно 60 Å. В белке 17 альфа-спиралей и 16 бета-тяжей. Кроме того, в нём присутствуют следующие гетерогруппы: 5 ионов магния (показаны на рисунке), 1 сульфат-ион и 506 молекул воды.

На рисунке изображена 3D-структура белка ENO_ECOLI в остовной модели. Подписано английское название белка, а также лиганд (в данном случае ионы магния).

# Зона контакта цепи А и магния.
define cont_B_M 245A, 289A, 316A
define AA1 316A
define AA2 289A
define mg1 mg and *A
define contact asp245:a.od2, glu289:a.oe2, asp316:a.od2

Данный скрипт определяет аминокислотные остатки в цепи А белка ENO_ECOLI, которые взаимодействуют с ионом магния. Он также определяет объекты генно-инженерного эксперимента (два остатка — аспарагиновую и глутаминовую кислоту).