Энолаза (enolase)

Краткое название белка — ENO_ECOLI
Полное название организма — Escherichia coli, K-12
Название гена — eno
Номер локуса в бактериальной хромосоме — b2779

Последовательность в формате FASTA:

>ENO_ECOLI enolase

MSKIVKIIGREIIDSRGNPTVEAEVHLEGGFVGMAAAPSGASTG              
SREALELRDGDKSRFLGKGVTKAVAAVNGPIAQALIGKDAKDQAGIDKIMIDLDGTEN
KSKFGANAILAVSLANAKAAAAAKGMPLYEHIAELNGTPGKYSMPVPMMNIINGGEHA
DNNVDIQEFMIQPVGAKTVKEAIRMGSEVFHHLAKVLKAKGMNTAVGDEGGYAPNLGS
NAEALAVIAEAVKAAGYELGKDITLAMDCAASEFYKDGKYVLAGEGNKAFTSEEFTHF
LEELTKQYPIVSIEDGLDESDWDGFAYQTKVLGDKIQLVGDDLFVTNTKILKEGIEKG
IANSILIKFNQIGSLTETLAAIKMAKDAGYTAVISHRSGETEDATIADLAVGTAAGQI
KTGSMSRSDRVAKYNQLIRIEEALGEKAPYNGRKEIKGQA

Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав белка

A (аланин) 13,7%

C (цистеин) 0,2%

D (аспарагиновая кислота) 5,8%

E (глутаминовая кислота) 7,9%

F (фенилаланин) 2,8%

G (глицин) 10,9%

H (гистидин) 1,6%

I (изолейцин) 8,1%

K (лизин) 8,6%

L (лейцин) 6,9%

M (метионин) 3,0%

N (аспарагин) 4,4%

P (пролин) 2,5%

Q (глутамин) 2,5%

R (аргинин) 2,5%

S (серин) 5,1%

T (треонин) 4,9%

V (валин) 5,8%

W (триптофан) 0,2%

Y (тирозин) 2,5%

Длина последовательности — 432 а.о.
Молярная масса — 45661 г/моль.
Средний заряд молекулы при pH=7,0 — -10,09.
Отношение содержания гидрофобных остатков (A, C, F, I, L, M, V) к содержанию гидрофильных (D, E, H, K, N, Q, R, S) — 1,054217, что позволяет думать, что данный белок не является мембранным, потому что количество гидрофобных остатков в нём примерно равно количеству гидрофильных, а у мембранных белков (например, у бактериальных транспортеров класса TC.2A) гидрофобных аминокислотных остатков намного больше (у бактериальных транспортеров данное отношение равно 7,3706).

© Кривошей Александр, 2004