Выравнивание последовательностей

1.GeneDoc


Ссылка на изображение
Ссылка на выравнивание

Процент идентичности: 14/22*100= 63,63%
Процент сходства 14/22*100= 63,63% ( процент сходства совпал с процентом идентичности,т.к. среди несовпавших букв сходных нет)

2.Blast 2 sequences


Координаты последовательности seq1 в полной последовательности белка:
начало - 37
конец - 56

3.Dot matrix view


Карта локального сходства для белка RNPH_GEOLS из Geobacter lovleyi и белка RNPH_BACSU из Bacillus subtilis



  • Identities = 145/238 (61%)
  • Positives = 181/238 (77%)
  • Gaps = 1/238 (0%)
  • Координаты выровненного участка :
    1-238 (RNPH_BACSU) и 1-237 (RNPH_GEOLS)

    Дополнительное задание



    Ссылка на выравнивание



    •    

    © Алиса Муравьева. Все права защищены.