Поисковые системы


Задание 1.

  • Uniprot - отсутствует информация о датах
  • Srs - хорошо описана вторичная структура , можно просматривать последовательность в разных форматах, симпатичный интерфейс
  • Mrs - отсутствует меню разделов, зато при наведении курсора на элемент вторичной структуры белка- показывается его код.

    Задание 2

  • Bacillaceae(семейство)
  • Bacillales(порядок)
  • Bacillariaceae(семейство)
  • Bacillariales(порядок)
  • Bacillariophyceae(семейство)
  • Bacillariophycidae(класс)
  • Bacillariophyta(отдел)
  • Bacillus(род)

  • В банке SwissProt 15224 записей, описывающих белки из рода Bacillus.
  • В банке SwissProt 67277 записей, описывающих белки из отдела Firmicutes.

    Задание 3

    Формулировка функции белкаСтрока запросаКоличество найденных документов
    Phosphorolytic exoribonuclease ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & (([swissprot-Comment:Phosphorolytic] & [swissprot-Comment:exoribonuclease]) > parent )) 53
    Ribonuclease PH ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & ([swissprot-Description:Ribonuclease] & [swissprot-Description:PH])) 53
    tRNA nucleotidyltransferase ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & ([swissprot-Description:tRNA] & [swissprot-Description:nucleotidyltransferase])) 148

    Задание 4

    последовательности, для одного из запросов в fasta-формате

    Задание 5

    Список статей Cфера научных интересов А.А. Нейфаха - белок multidrug efflux transporter.

    Задание 6

  • 18202 записи по запросу grep '^ID^ -c /P/y10/Term_2/Block1/Practice3/bacsu.gbk
  • 20 записей по запросу grep '^RN^ /P/y10/Term_2/Block1/Practice3/bacsu.gbk | grep '1[012345]' -c


    •    

    © Алиса Муравьева. Все права защищены.