UniProt:



Название поля

Метка поля

Содержание

Код доступа ("Accession number")

AC

P28619

Идентификатор записи в БД

ID

RNPH_BACSU

Название (краткое описание) белка

DE

RecName: Full=Ribonuclease PH;

Short=RNase PH;

EC=2.7.7.56;

AltName: Full=tRNA nucleotidyltransferase;

Дата создания документа

DT

01-DEC-1992

Дата последнего исправления аннотации

DT

30-NOV-2010

Число публикаций, использованных при создании документа

RN

3

Журнал и год самой поздней публикации

RL

Журнал : Nature , 1997

Ключевые слова

KW

3D-structure; Complete proteome; Nucleotidyltransferase; Transferase;

tRNA processing.

Что содержит поле комментариев?

CC

ФУНКЦИЯ: Phosphorolytic exoribonuclease (фосфоролитическая экзорибонуклеаза), которая удаляет нуклеотидные
остатки после -ССА конца тРНК и добавляет нуклеотиды
к концам молекул РНК с помощью нуклеозида дифосфаты как
субстрата.
КАТАЛИТИЧЕСКИЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ: тРНК (N +1) + фосфат = тРНК (п) + нуклеозид
дифосфат.

Сходство: относится к семейству РНК PH.

Идентификаторы записей PDB

DR

10YR, 10YP, 10YS

Субстрат реакции, катализируемой этим белком - нуклеозид дифосфата

 

Количество белков в UniProt, имеющих примерно тоже описание (DE), что и белок RNPH_BACSU:

Запрос

Число записей в SwissProt

Число записей в TrEMBL

nucleotidyltransferase

12422

241853

Ribonuclease PH

508

1309

Ribonuclease PH AND nucleotidyltransferase

423

1133

 

 

Сравнительная таблица по белкам : RNPH_BACSU и  RNPH_ECOBW  

 

 Название поля

Метка поля

RNPH_BACSU

RNPH_ECOBW

Первый код доступа

 AC

 P28619

 P0CG18

 

Идентификатор последовательности в БД

ID

 RNPH_BACSU

 RNPH_ECOBW

Название (краткое описание) белка

 DE

 RecName: Full=Ribonuclease PH;

Short=RNase PH;

EC=2.7.7.56;

AltName: Full=tRNA nucleotidyltransferase;

 RecName: Full=Ribonuclease PH;
        Short=RNase PH;
        EC=2.7.7.56;
   AltName: Full=tRNA nucleotidyltransferase;

 

Дата создания документа

 DT

 01-DEC-1992

 15-JUN-2010

 

Дата последнего исправления аннотации

DT

 30-NOV-2010

 08-FEB-2011

 

Название организма

  OS

  Bacillus subtilis

 Escherichia coli 

 

Классификация организма (список таксонов)

 OC

 Bacteria;

Firmicutes;

Bacillales;

Bacillaceae;

Bacillus

 Bacteria;
 
 Proteobacteria; 
 
Gammaproteobacteria; 
 
Enterobacteriales;
 
Enterobacteriaceae; 
 
Escherichia.

 

Длина последовательности

 ID(SQ)

 245 AA

 238 AA

 

Молекулярная масса белка

 SQ

 26681 MW (MW - molar weight, измеряется в дальтонах.)

 25352 MW

 

Число публикаций, использованных при создании документа

 RN

 3

  6

Журнал и год самой поздней публикации

 RL

 Журнал : Nature , 1997

 

J. Bacteriol, 2009
 

 

Описание вторичной структуры

 FT

 STRAND 14 17

STRAND 28 32

STRAND 35 45

HELIX 49 51

STRAND 58 64

HELIX 86 100

HELIX 104 107

STRAND 111 120

HELIX 125 146

STRAND 149 152

STRAND 159 167

TURN 168 170

STRAND 171 175

HELIX 178 183

STRAND 185 193

STRAND 198 207

HELIX 212 236

HELIX 238 240

 

  Информация не представлена 

Ключевые слова

KW

  3D-structure; Complete proteome; Nucleotidyltransferase; Transferase; tRNA processing

 Complete proteome; Direct protein sequencing; Nucleotidyltransferase; Transferase; tRNA processing

Темы, освещённые в комментариях

CC

  ФУНКЦИЯ: Phosphorolytic exoribonuclease (фосфоролитическая экзорибонуклеаза), которая удаляет нуклеотидные остатки после -ССА конца тРНК и добавляет нуклеотиды к концам молекул РНК с помощью нуклеозида дифосфаты как субстрата. КАТАЛИТИЧЕСКИЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ: тРНК (N +1) + фосфат = тРНК (п) + нуклеозид дифосфат. Сходство: относится к семейству РНК PH.

ФУНКЦИЯ: Phosphorolytic exoribonuclease (фосфоролитическая экзорибонуклеаза), которая удаляет нуклеотидные остатки после -ССА конца тРНК и добавляет нуклеотиды к концам молекул РНК с помощью нуклеозида дифосфаты как субстрата. КАТАЛИТИЧЕСКИЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ: тРНК (N +1) + фосфат = тРНК (п) + нуклеозид дифосфат. СУБЪЕДИНИЦЫ: гомодимер (Вероятно) Сходство: относится к семейству РНК PH

Особенности последовательности

FT

  Информация не представлена

Информация не представлена

Идентификаторы записей PDB

DR

  10YR, 10YP, 10YS

Информация не представлена



Впечатления от сравнения двух записей.

Оба белка выполняют одну и ту же функцию и катализируют одну и ту же реакцию; оба живут в бактериях, но в разных. Геном второго белока секвенирован сравнительно недавно.
   

© Алиса Муравьева. Все права защищены.