A- и В- формы ДНК
Описание различных форм ДНК
A-форма
B-форма
Z-форма
| A-форма | B-форма | Z-форма | |
| Большая бороздка | N3 O2 C2 | N3 O2 C2 | C4 C5 C6 N4 |
| Малая бороздка (A) | C4 C5 C6 N4 | C4 C5 C6 N4 | N3 O2 C2 |
| Остальные атомы основания | N1 | N1 | N1 |
Атомы, обращенные к большой бороздке отмечены красным цветом, к малой - синим.
Сравнение основных спиральных параметров разных форм ДНК.
| А-форма | В-форма | Z-форма | |
|---|---|---|---|
| Тип спирали | Правая | Правая | Левая |
| Шаг спирали (Å) | 28.03 | 33.75 | 43.50 |
| Число оснований на виток | 11 | 10 | 12 |
| Ширина большой бороздки (Å) | 7.98 | 17.21 | 9.86 |
| Ширина малой бороздки (Å) | 16.81 | 11.69 | 16.08 |
Сравнение торсионных углов в структурах А- и В-форм для Цитозина.
| α (P-O5') | β (O5'-C5') | γ (C5'-C4') | δ (C4'-C3') | ε (C3'-O3') | ζ (O3'-P) | χ (C1'-N) | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| А-ДНК | -51.68o | 174.79o | 41.73o | 79.05o | -147.78o | -75.05o | -157.18o |
| В-ДНК | -29.89o | 136.35o | 31.14o | 143.40o | -140.77o | -160.50o | -97.99o |
Полученные значения торсионных углов сильно отличаются от значений,
приведенных в презентации, так как :
1)углы измерялись в ДНК , а не в РНК ;
2)углы измерялись для цитозина, а не для гуанина.
© Алиса Муравьева. Все права защищены.