Реконструкция дерева с помощью TreeTop
К достоинствам TreeTop можно отнести то, что сервер выдает 2 варианта деревьев, построенных по разным алгоритмам, а также матрицу расстояний. Интересно отметить, что также на сервере есть описание принципа работы этих алгоритмов. Несомненным недостатком является то, что сервер работает не с последовательностями, а с выравниваниями. Кроме того было бы хорошо, на мой взгляд, поработать с дизайном сайта.Деревья , полученные с помошью TreeTop , отличаются от правильного, но есть и совпадающие ветви.
Distance Matrix
1 2 3 4 5 6 7 8
1 LACAC 0.000 0.553 0.635 0.567 0.587 0.572 0.490 0.529
2 LACLM 0.553 0.000 0.706 0.622 0.654 0.627 0.526 0.459
3 CLOB1 0.635 0.706 0.000 0.425 0.515 0.423 0.547 0.693
4 STAES 0.567 0.622 0.425 0.000 0.395 0.293 0.436 0.603
5 GEOKA 0.587 0.654 0.515 0.395 0.000 0.368 0.477 0.636
6 BACSU 0.572 0.627 0.423 0.293 0.368 0.000 0.445 0.610
7 ENTFA 0.490 0.526 0.547 0.436 0.477 0.445 0.000 0.517
8 STRPN 0.529 0.459 0.693 0.603 0.636 0.610 0.517 0.000