Эволюция доменной архитектуры
Сведения о домене
| AC | ID | Функция | Число разных архитектур | Число представителей | Ссылка на PFAM |
| PF02737 | 3HCDH_N | 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа, НАД-связывающий домен. Домен бактерий, архей, эукариот, длиной практически 50 а.о. | 42 | 1862 | Pfam ref |
Сведения об архитектурах
| Название архитектуры | Число представителей | Характеристика других доменов | Как выглядит |
| ECH, 3HCDH_N, 3HCDH | 930 | ECH (PF00378) - еноил-КоА гидратаза/изомераза. Входит в 96 различные архитектуры.
3HCDH (PF00725)- 3-гидрокси-КоА дегидрогеназа, С-терминальный домен. Входит в 35 архитектур. |  |
| 3HCDH_N, 3HCDH, 4HBT_2 | 62 | 3HCDH (PF00725)- 3-гидрокси-КоА дегидрогеназа, С-терминальный домен. Входит в 35 архитектур.
4HBT_2 (PF13279) - тиоэстераза-подобные белки. Входят в 15 архитектур. |  |
Смотреть файл c выравниванием.
Выбор последовательностей
Были отобрано множество последовательностей с двумя различными архитектурами. Номер архитектуры (1 или 2) соответствует порядковому номеру соответствующей архитектуры в таблице выше. Были взяты несколько таксонов и закодировано следующим образом:
| Sphingomonadales | S |
| Rhodobacterales | Rhod |
| Rhizobiales | Rhiz |