рис.1 тРНК (pdb id="1gts")
| Участок структуры | Позиции в структуре (по результатам find_pair) | Результаты предсказания с помощью einverted | Результаты предсказания по алгоритму Зукера |
| Акцепторный стебель | 5' - 2-7 - 3' 5' - 66-71 - 3' 6 канонических пар |
Найдено 6 канонических пар | Найдены все 6 канонических пар |
| D-стебель |
5' - 10-12 - 3' 5' - 25-23 - 3' 3 канонические пары |
Не найден | Найдены все 3 канонические пары |
| T-стебель |
5' - 49-54 - 3' 5' - 65-61 - 3' 5 канонических пар |
Не найден | Найдены все 5 канонических пар |
| Антикодоновый стебель |
5' - 37-44 - 3' 5' - 33-26 - 3' 8 пар (5 канонических) |
Найдено 5 канонических пар | Найдены все 5 канонических пар |
| Общее число канонических пар нуклеотидов | 22 пары (19 канонических) | 19 пар (11 канонических) | Найдены все канонические пары |
| Контакты атомов белка с | Полярные | Неполярные | Всего |
| остатками 2'-дезоксирибозы | 1 | 24 | 25 |
| остатками 2'-дезоксирибозы | 8 | 13 | 21 |
| остатками азотистых оснований со стороны большой бороздки | 0 | 7 | 7 |
| остатками азотистых оснований со стороны малой бороздки | 16 | 0 | 16 |
PDF-файл, полученный в результате работы nucplot.
 |
Asn81 контактирует с цитозином и тимином
 |
Lys25 контактирует с тимином и сахаро-фосфатным остовом
 |