Практикумы №1-2

Филогенетические деревья

Отобранные бактерии

Название Мнемоника
Bacillus subtilis BACSU
Clostridium tetani CLOTE
Enterococcus faecalis ENTFA
Lactobacillus acidophilus LACAC
Listeria monocytogenes serovar 1/2a LISMO
Moorella thermoacetica MOOTA
Streptococcus pyogenes serotype M1 STRP1
Streptococcus pneumoniae serotype 4 STRPN

Скобочная формула дерева

 ((((STRP1, STRPN), LACAC), ENTFA, (LISMO, BACSU)), (MOOTA, CLOTE)); 

Ссылка на файл формата .tree

Изображение дерева

Филогенетическое дерево

Ветви дерева

Дерево содержит 5 нетривиальныx ветвей:

1){CLOTE, MOOTA} против {BASQU, LISMO, ENTFA, LACAC, STRPN, STRP1}

2){CLOTE, MOOTA, BACSU} против {LISMO, ENTFA, LACAC, STRPN, STRP1}

3){CLOTE, MOOTA, BACSU, LISMO} против {ENTFA, LACAC, STRPN, STRP1}

4){CLOTE, MOOTA, BACSU, LISMO, ENTFA} против {LACAC, STRPN, STRP1}

5){CLOTE, MOOTA, BACSU, LISMO, ENTFA, LACAC} против {STRPN, STRP1}

Реконструкция филогении

Выделение таксонов

1){CLOTE, MOOTA} - Clostridia (class)

2){CLOTE, MOOTA, BACSU, LISMO, ENTFA, LACAC} - Firmicutes (phylum)

3){ENTFA, LACAC, STRPN, STRP1} - Lactobacillales (order)

4){LISMO, ENTFA, LACAC, STRPN, STRP1} - Bacilli (class)

5){STRPN, STRP1} - Streptococcus (genus)

Вернуться на главную страницу