1) Файл list25.txt
2) 37 ID (2 одинаковы, фактически 36)
3) Выдача: 34 из 36 ID. Оставшиеся ID относятся к категориям unmapped и multiple mapping information
4) 10 наиболее значимых GO terms: GO:0019318, GO:0005996, GO:1901135, GO:0005975, GO:0006000, GO:0046835, GO:0044281, GO:0044262, GO:0006096, GO:0006757
Графа с 5-ю самми значимыми GO terms
5) Все узлы графа соединены отношениями одного типа - "Is a"
6) Все ID из списка объединяет участие в органических метаболических процессах (белки метаболизма углеводов)
String graph
- C12orf5 - Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR
Не удалось получить связи между всеми узлами даже при использовании "more". 7 белков не связаны с другими, для FN3KRP не представлена 3D-структура. Остальные белки имеют все типы связей (известные, предсказанные и другие категории)
Cooccrurrence
Можно выделить консервативную группу - Opisthokonta. Белки часто встречаются Eukariota. Также представлены у некоторых Archea и Bacteria. Некоторые белки впервые появились у Bacteria (AMIGO3, HKDC1), другие - уже только у Eukariota (DLX4, POLR3H)
Coexpression
У человека коэкспрессия генов слабо проявляется, кроме пары GMPPA и GMPPB. Для остальных организмов уровни коэкспрессии заметно выше
1) ID: SORD
2) Сорбитолдегидрогеназа (SORD) катализирует преобразование полиолов и отвечающих им кетозам, участвует в полиоловом пути (играет важную роль в развитии диабета). Первая реакция пути - удаление глюкозы с образованием сорбита (с помощью ALDR1). Затем SORD (+ кофактор NAD(+)) окисляет сорбит до фруктозы.
3) Нет спецификаций в какой-либо из областей головного мозга
4) В основном расположен в цитозоле
5) При высоком уровоне экспрессии различие почти отсутствует только в тканях эндокринной системы и печени
6) Наиболее высокая экспрессия РНК в щитовидной железе и печени, средняя в некоторых половых органах, гарнулоцитах (зернистых лейкоцитах)