"Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)"

№1 Определение метаболических путей, в которых участвует данный фермент

Мой белок - CGT_HUMAN. Было найдено 2 метаболических пути:

hsa00600 Sphingolipid metabolism, метаболизм сфинголипидов

hsa01100 Metabolic pathways, метаболические пути

Метаболизм сфинголипидов

Поиск структурных формул заданных соединений

ID	Русское название	Английское название	Структура
C00047	L-Лизин	L-Lysine
C00024	Ацетил-коА	Acetyl-CoA

Поиск метаболического пути от одного заданного вещества к другому

Карта: биосинтез лизина

Путь: ацетил-коА ----> L-лизин

Сравнение метаболических путей у разных организмов

Организм	Цепочка реакций возможна	Обоснование
Bacillus subtilis	да	присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
Archaeoglobus fulgidus	да	присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
Arabidopsis thaliana	да	присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
Homo sapiens	да	присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций

Вышло так, что для всех данных организмов совпадает биосинтез лизина вплоть до промежуточных продуктов и ферментов.

Мнение о KEGG

На мой взгляд, KEGG является очень удобной базой данных. С помощью неё можно найти практически любую интересующую тебя информацию касательно определённого гена, фермента, метаболического пути и так далее. У меня, например, была задача разобраться, в каких сигнальных и метаболических путях задействованы определенные гены (курсовая работа). И для решения этой проблемы KEGG оказался как раз кстати. KEGG может оказаться очень полезным для медицины. В KEGG DISEASE можно найти информацию о пути развития определённого заболевания. Вот, например, схема развития глиомы: