Практикум 2. Реконструкция филогении

Используя сайт NCBI, определим к каким таксонам относятся отобранные мной бактерии из первого практикума.

Все отобранные бактерии относятся к Proteobacteria -

1.BRADU - Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Bradyrhizobium - Bradyrhizobium diazoefficiens

2.RHIEC - Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Rhizobium - Rhizobium etli

3.BURCA - Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Burkholderia; Burkholderia cepacia complex - Burkholderia cenocepacia

4.NEIMA - Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Neisseria - Neisseria meningitidis

5.ENT38 - Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter - Enterobacter sp. 638

6.SALTY - Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Salmonella; Salmonella enterica; Salmonella enterica subsp. - Salmonella typhimurium

7.YERPS - Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Yersinia; Yersinia pseudotuberculosis complex - Yersinia pseudotuberculosis

8.PASMU - Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Pasteurella - Pasteurella multocida

1.(BRADU,RHIEC),(BURCA,NEIMA,ENT38,SALTY,YERPS,PASMU) выделяет два класса:Alphaproteobacteria и Gammaproteobacteria

2.(BURCA,NEIMA),(BRADU,RHIEC,ENT38,SALTY,YERPS,PASMU) отделяет класс Betaproteobacteria

3.(ENT38,SALTY),(BRADU,RHIEC,BURCA,NEIMA,YERPS,PASMU)

4.(ENT38,SALTY,YERPS),(BRADU,RHIEC,BURCA,NEIMA,PASMU) выделяет семейство Enterobacteriaceae

5.(BRADU,RHIEC,BURCA,NEIMA),(ENT38,SALTY,YERPS,PASMU)

Рис1.Дерево отобранных бактерий