Краткое описание генома вируса Cycas necrotic stunt virus

Вирус поражает растения, в том числе голосеменные. Это единственный хорошо охарактеризованный вирус голосеменных. Род Nepovirus, подгруппа b. Последовательности белков похожи на таковые у Artichoke Italian latent virus, Grapevine chrome mosaic virus и Tomato black ring virus. Геном состоит из РНК1 и РНК2. Каждая РНК кодирует один белок, по бокам гена которого некодирующие последовательности и полиадениновый хвост [1]. В таблице 1 приведены некоторые важные количественные и качественные показатели, характеризующие вид Cycas necrotic stunt virus
Таблица 1. Основные параметры генома вируса Cycas necrotic stunt virus

Параметр	Значение
Английское название вируса	Cycas necrotic stunt virus
Русское название вируса	Некротический вирус саговника
Количество фрагментов в полном геноме	2
Общая длина генома (п.н.)	7471
Количество кодируемых в геноме полипептидов	2
Количество "зрелых" вирусных белков	2

>NP_620620.2 polyprotien 2
MFAPIGAPGMGERASQNFRSASGFRDLLVHAVKVLVLSAYQRRPCTSMLRPREQKRIKMR
LKWMCLMKFCFMQNNYWDTQRRFTGGMHNVPELATFDAWLQHWRVVHWRLNIISEILIDF
QALVRMMKNLAGQCHFDFYPVCTHCVQLVNNWYIAEFKPHLEEETEWWKDLVKPRMGNPV
HEIEPNRKSQYVESRRIPPPLNGDEFANFLHVCQCAKLAFDVERAATEENFEDALDTLEE
DFYDIDSTIPKRDLLAADARVVKRAFTLRRKRRPNRTSVYSMKGQPPVTFSASDLVSCLG
QVLSTLPTVKMDREAIEDQQDHLEDKQGGEILTTPQFIEVLRKKKREVREKEFDDSTQGK
LLPAEDFTLSKHDVFLANSVLDGLRKSKLIQRFAGKCATSTKITVDLTNKEEVVRYGPKE
LASEGFRQTFNVLNRPEYNALNKLAEAGWKEAKSVVLNLHIRSYLPQQMNAYAFCVIMWG
HSSDAQEAALSGSYVYLGDGEATMLQLPLLCEYVGHNLQDFEAYKRSLVLSTVFPEFSGI
ADGKAMFGITSIEFTEYLPTSHAGITHERDSWDAMLRNHTEEKRRFLAGFNVVDTIEKGN
RKGFSFPDFDLKAVPRHQAVVRTFEDQDVAPILSKAKSMRVKTFGSFRAGNIPVNFLGTP
SNGQVASKHSVSENAGYSVGDMKSAENFVFTQLITVPAASTKGNVLAGVDILANARTTMS
GFYMRWLQKGYIDTNLKLICHLPRAPFAGMSFFVLIDGTGYLAKDAPTSLNEEEILSYPL
HLVTTSDVSSYEFVLDWHRYIGQVPFAEENAFLRPTLFLVACVSSTLALSAKVEFYLEAQ
SVGEELPRTLAPSPVLSYPFQNSFLEDLDLFLPPKRLTLGERETTIIPLSFAKSKKSGDA
VLYSHAAARLAHFQGIGGVLHGVVYLVGSQLVASQSRISMWSKEQHIQHQAVNVHVDTDT
GVAFDLPIKDAFYASSVYGDSGAVIQVTCLCSPMSPNAIKAPFDMIFKIRGFTPDAPMCR
TINFTQRFGWFAVEPTTSTGAIKLKIWPVSNHLESEDMKVTGYTNAFLQMCQTSTMHFGS
VIIHFSWTLFGGTTNAATAGGVVTIAEGFGPEEENFRGHCRNLSIYEGRATVPLELGTFA
GPTPLKKLDFKYRNWIRFTTPKGRNISSIFCAIEVLPGFSFYGRTGSPRLSVVGTTVPPT
ADASTSNSQGGDEDIGDQYSAALGRGRGRGSRPGPSPIRG

[1] Han S. S. et al. Nucleotide sequence and taxonomy of Cycas necrotic stunt virus //Archives of virology. – 2002. – Т. 147. – №. 11. – С. 2207-2214.