STRUCTURE OF BACILLUS PUMILUS CATALASE
jmol1.spt jmol1.1.sptТипичные параметры водородных связей в элементах вторичной структуры белка
| Атомы (цепь A) | Длина связи N-O в Ангстремах | Угол N-O-C o |
| Альфа-спирали | ||
| N(46 Phe)-O(42 Lys) | 3.09 | 148.6 |
| N(82 Leu)-O(79 Ala) | 3.11 | 121.3 |
| N(147 Val)-O(143 Phe) | 2.9 | 164.2 |
| N(186 Gly)-O(183 Ser) | 3.11 | 122.7 |
| N(237 Ala)-O(233 Ala) | 3.0 | 152.8 |
| N(245 Arg)-O(241 Gln) | 3.01 | 162.2 |
| N(248 Tyr)-O(244 Thr) | 3.18 | 154.3 |
| N(254 Gly)-O(251 Ile) | 3.11 | 109.3 |
| N(334 Glu)-O(330 Asp) | 2.96 | 157.1 |
| N(475 Ala)-O(471 Gly) | 2.93 | 155.8 |
| Вывод: в альфа-спиралях среднее значение длины связи N-O 3.04 Ангстрема, а средний угол N-O-C 144.83o | ||
| Бета-тяжи | ||
| N(302 Arg)-O(64 Tyr) | 3.21 | 139.7 |
| N(65 Gly)-O(91 Val) | 3.0 | 136.5 |
| N(89 Thr)-O(67 Phe) | 2.88 | 158.2 |
| N(96 Ser)-O(113 Gly) | 3.25 | 120.0 |
| N(130 Asn)-O(197 Ser) | 3.22 | 156.7 |
| N(203 Arg)-O(326 Glu) | 2.92 | 143.8 |
| N(213 Tyr)-O(266 Met) | 2.89 | 161.4 |
| N(215 Lys)-O(264 Gln) | 3.02 | 147.9 |
| N(262 Tyr)-O(217 His) | 2.84 | 160.2 |
| N(293 Gln)-O(263 Val) | 2.83 | 155.0 | Вывод: в бета-тяжах среднее значение длины связи N-O 3.006 Ангстрема, а средний угол N-O-C 147.94o |