 |
Целью данного занятия было овладевание программой MarvinSketch и знакомство со
структурой нуклеотидов. К каждому заданию прилагается ссылка на файл с формулами
в формате mrv.
Задание 1 (nucl.mrv) В программе MarvinSketch нарисованы (слева): 2'-дезоксигуанозиндифосфат, 2'-дезокситимидинмонофосфат, уридин и псевдоуридин Пронумерованы атомы остатков азотистых оснований (без штриха) и сахара (со штрихом). Красным цветом выделены атомы, связанные N-гликозидной связью. Задание 2 (2ch.mrv) Нарисован фрагмент двухцепочечной ДНК (справа), остатки фосфорилированных сахаров выделены красным, подписаны основания, обозначены 3' и 5' концы, указано направление считывания, водородные связи обозначены пунктиром. |
 |
Задание 3 (necanon.mrv)
Изображены канонические связи аденина с тимином и урацилом
и возможные неканонические связи с тимином, урацилом,
аденином, гуанином и цитозином. Если предположить, что распространенность пары зависит от
расположения азотистых оснований относительно остатков сахаров, то самая распространенная
неканоническая пара - это A-G. Можно заметить, что связи N9-C1' в обоих нуклеотидах расположены так же,
как и в канонических парах.
