Краткое описание генома вируса Faeces-associated gemycircularvirus 8

Вирус Faeces-associated gemycircularvirus 8 был найден в фекалиях чатемской петроики - небольшой птицы из отряда воробьинообразных класса австралийских зарянок, обитающей на одном из архипелагов Новой Зеландии [1]. Судя по строению генома, способен вызывать заболевания у грибов [2]. В таблице приведены некоторые важные количественные и качественные показатели, характеризующие данный вирус.

Таблица 1. Основные параметры генома вируса Faeces-associated gemycircularvirus 8

Параметр Значение
Английское название вируса Faeces-associated gemycircularvirus 8
Русское название вируса Фекалиесвязанный близнецеподобный кольцевой вирус (ФеБлиКольВ) 8
Количество фрагментов в полном геноме 1
Общая длина генома 2174
Количество кодируемых в геноме полипептидов 2
Количество "зрелых" вирусных белков 2

Последовательность белка YP_009109722.1

YP_009109722.1

>YP_009109722.1 capsid protein
MAYARRRFTSSRARKPIRRSRRPAGKRRSYRRSTRKRGMSTRTLLNKTSQKKRDNMLSFS
NTTAEDPFSTDYTIGPAVMRRPVGADLPAEFIYVWNATGRPHELSTGFRGSKIDTSLRTN
TTIFAVGLKERIKLETNNSAPWRWRRICFTSKNDYGEADPDESDYFRRTSNGMVRLLRAQ
SQAEEINDDVFDGQRNVDWLSAITAPINRRHVSVHYDRTRTIQSGNQSGVTRTYRQWHPM
RKNVVYADEQAGEGMVDSGVSVTGKVGMGNYYVMDIFTKHGLNDDQSTLSYEPESTFFWH
EK

Описание

Белок капсида

Источники

[1] DNA virus, Wikipedia, the free encyclopedia 2016.
[2] Sequence: KF371634.1, European nucleotide archive 2016.
© Ириоглов Роман 2016