Ферменты и метаболические пути. База данных KEGG.

Общие сведения о метаболическом пути биосинтеза лизина

Map
Это ссылка на базу данных KEGG

map00300

Поясняю про путь

Лизин - одна из 8 незаменимых аминокислот, и должен поступать в организм с растительной пищей. Биосинтез лизина происходит у грибов, растений, бактерий и евгленовых. Основной путь биосинтеза лизина - аспартатный, и исходным веществом будет являться (не поверите!) аспарагиновая кислота (также известна как аспартат, Asp, D). Этот путь активно применяют растения и большинство бактерий. Однако не будет лишним упомянуть ещё один путь синтеза - альфа-аминоадипиновый, который используют грибы, евгленовые и некоторые эукариоты. В нём исходными веществами являются ацетил-КоА и альфа-кетоглутаровая кислота, из которых по цепи реакций синтезируется альфа-аминоадипиновая кислота, в честь которой и назван путь.

Метаболический путь биосинтеза лизина в разных доменах жизни

Бактерии

Организм: Paenibacillus naphthalenovorans
Царство: Bacteria
Отдел: Firmicutes
Класс: Bacilli
Порядок: Bacillales
Семейство: Paenibacillaceae

Paeni

Археи

Организм: Pyrococcus abyssi
Царство: Euryarchaeota
Филум: Euryarchaeota
Класс: Thermococci
Порядок: Thermococcales
Семейство: Thermococcaceae

Pyro

Эукариоты

Организм: Vigna angularis (Адзуки, Вигна угловатая, Фасоль угловатая)
Царство: Plantae
Отдел: Angiospermae
Класс: Eudicotidae
Порядок: Fabales
Семейство: Fabaceae

Adzuki

У всех 3 представителей можем увидеть полный аспартатный путь, а у археи - функционирует своя версия альфа-аминоадипинового пути, хотя саму альфа-аминоадипиновую кислоту она синтезирует по-другому. Эта архея - экстремофил; вероятно, использование нескольких путей синтеза делает её более устойчивой к неблагоприятным условиям.

Реакция синтеза гомоцитрата в базе данных KEGG

Это ссылка на реакцию в базе данных KEGG REACTION Идентификатор: R00271

Citrus
© Ириоглов Роман 2017-2018