Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
# | Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-O-C (°) |
Альфа сприрали |
1 | N(396:B)-O(392) | 2.78 | 167.6 |
2 | N(401:A)-O(397) | 3.0 | 167.2 |
3 | N(129:A)-O(125) | 2.92 | 159.6 |
Бетта листы |
4 | N(191:B)-O(194:B) | 3.36 | 129.6 |
5 | N(96:B)-O(109:B) | 2.89 | 122.5 |
6 | N(344:B)-O(340:B) | 3.66 | 129.9 |
Согласно данным, приведенным в таблице, длина водородной связи слабо зависти от
от вида вторичной структуры белка и варьируются в пределах 2.81-3.49 Å.
Угол же(N-O-C), согласно этой выборке, больше у альфа спиралии: 167.6-159.6°, в то время как для бетта листа: 122.5-129.9°.
Несмотря на малое количество рассмотренных связей, общие характеристики
водородной связи, скорее всего, слабо отличаются от полученных
(имеется в виду водородная связь с участием атома кислорода).
Это логически понятно, так как водородная связь в этом случае образована
по единому принципу, меняются лишь соседние атомы.
Известно, что длины водородных связей строго фиксированы и, как показывают
исследования, составляют немного меньше З Å. Расстояние
между соседними участками полипептидной цепи в структуре складчатого слоя составляет в среднем 2.72Å,
что соответствует длине водородной связи между группами -СО- и -NH-.
|
на главную |
Страница находится в стадии разработки © Гавриш Глеб 2016 |
|