Протеомы и EMBOSS

Назад

В таблице приведены результаты сравнения частоты аминокислот в протеомах Methylomicrobium alcaliphilum 20 Z (Proteome ID: UP000008315, 4,041 последовательностей, 1 287 047 а.о.) и Escherichia coli K12 (Proteom ID: UP000000625б 4,306 последовательностей и 1 356 086 а.о.) Три самые популярные (лейцин, аланин, глицин) и три самые не популярные (гистидин, триптофан, цистеин) аминокислоты в данных последовательностях одинаковы. У Methylomicrobium alcaliphilum 20 Z отсутствует селеноцистеин (U). По абсолютной величине самая большая разница для глутаминовой кислоты.Б.

Таблица 1. Сравнения частоты аминокислот в протеомах Methylomicrobium alcaliphilum 20 Z и E.coli.

Аминокислота

M. alcaliphilum, % АК

E. coli, % AK

Разность

L

10,77

10,67

0,1

A

8,83

9,52

-0,69

G

6,89

7,37

-0,48

I

6,64

6,01

0,63

E

6,46

5,76

0,7

V

6,44

7,07

-0,63

S

6,05

5,8

0,25

D

5,75

5,15

0,6

R

5,61

5,51

0,1

T

5,06

5,4

-0,34

K

5,04

4,41

0,63

P

4,31

4,43

-0,12

Q

4,24

4,44

-0,2

F

4,14

3,89

0,25

N

3,89

3,95

-0,06

Y

2,92

2,85

0,07

M

2,4

2,82

-0,42

H

2,29

2,27

0,02

W

1,26

1,53

-0,27

C

1,01

1,16

-0,15

U

-

0,0002

-

 

 

  
на главную

Страница находится в стадии разработки

© Гавриш Глеб 2016