Основы работы в MarvinSketch

Различные нуклеотиды

В программе MarvinSketch я построил различные молекулы, с нумерацией атомов. Программа позволяет использовать шаблоны и править длину и угол связей некоторых молекул, что очень облегчает работу (функцию выравнивания лучше применять только на небольшие молекулы, иначе получается белиберда, по крайней мере в 2d).

Собственно результат. Также доступен и в оригинальном формате: архив rar.

Двойная цепь

Цель - построить фрагмент двухцепочечной молекулы ДНК на плоскости.

Работу существенно облегчил шаблон ортофосфорной кислоты.

Обнаружились и проблемы программы: при, казалось бы, не сильно большом числе атомов, она начала существенно подтормаживать. Особенно при работе с атомами, у которых 4 и более связей (одинарных).

Собственно, результат. На длину некоторых связей можно не обращать внимание, так как в жизни такая молекула имеет 3х-мерную структуру.

Так же, на рисунок можно посмотреть и в оригинальном, векторном, формате(также архив).