Практикум 15

Trimmomatic

Отброшенные адепты 1,88% (98174)

Число оснований сократилось на 4,96% (253785)

Velvetg

N50=12042

ID Длина Покрытие
3 25915 27.418676
20 23850 24.763813
23 23807 25.725921

Контиг с ID 11 (длина 2106) имеет покрытие 126.008547, что примерно в 5 раз больше, чем стандартное покрытие.

Контиг с ID 167 (длина 96) имеет покрытие 4. 593750, что примерно в 5 раз меньше, чем стандартное покрытие.

MegaBlast

Контиг с ID 3. Координаты: 613658-620926, Gaps: 190 (2%); 621055-627104, Gaps: 240(3%); 2004-11103, Gaps: 252(2%).

Контиг с ID 20. Координаты 236918-247596, Gaps: 391(3%); 232358-236859, Gaps: 130(2%); 229411- 232057, Gaps: 71(2%); 248967-252161, Gaps: 94(2%).

Контиг c ID 23. Координаты 573092-582686, Gaps: 461(4%); 584329-587055, Gaps:108(3%); 593743-594099, Gaps:4(1%).