Построение 3d структуры ДНК разных типов
Файлы можно скачать по соответсвующим ссылкам: A-форма, В-форма, Z-форма.
A-форма | B-форма | Z-форма | |
Тип спирали | Правая | Правая | Левая |
Шаг спирали (Å) | 28 | 35,8 | 45,1 |
Число оснований на виток | 11 | 10 | 12 |
Ширина большой бороздки | 15,7(T) | 17,3(T) | 17,2(C) |
Ширина малой бороздки | 11,5(C) | 10(C) | 8,2(G) |
1)Торсионные углы:файл
2)Классификация динуклеотидов:файл
3)Стебли:
1- [G]902/[C]971-[A]907/[U]966;
2- [C]949/[G]965-[G]953/[C]961;
3- [A]937/[U]933-[C]944/[A]926;
4- [G]910/[C]925-[C]912/[G]923;
Для тРНК: №902 в файле <=> №1 в тРНК
4)Неканоничные пары:
[U]955/[G]918
[U]938/[U]932
[C]944/[A]926
[A]913/[A]945
5)Дополнительные водородные связи:
[U]954/[A]958
[U]955/[G]918
[A]913/[A]945
[A]914/[U]908
[G]915/[C]948
[G]919/[C]956