PF02463

Семейство доменов

RecF/RecN/SMC N-terminal domain

Параметр Значение
Pfam AC PF02463
Seed 28
Full 42097
Архитектуры 517
Таксономия бактерии, эукариоты, археи, вирусы
3D-структуры 74

Домен находится на N-конце белков SMC. Сверхсемейство SMC имеет АТФ-связывающие домены на N- и C-концах и два расширенных спиральных домена, разделенных шарниром. Эукариотические белки SMC образуют гетеродимеры и участвуют в динамике хроматина и ДНК. Семейство также включает RecF и RecN, участвующие в метаболизме и рекомбинации ДНК.

Скачать таблицу отчета 1

Представительная 3D-структура

Сравнение двух белков

Доменная архитектура Белок
PF02463 - PF06470 - PF00535 - PF00652 - PF00226 - PF17039 - PF00852 A0A0V1B345
PF14890 - PF14528 - PF02463 - PF06470 A0A1F7QBT0
Карта локального сходства двух белков
Карта локального сходства. E-value = 2e-18.

Интерпретация: дубликацию по координатам 50-100 можно объяснить дупликацией p-loop домена. Область 100-590 соответствует совпадению доменов SMC_N и SMC_hinge, область 1050-1254 соответствует домену SMC_N.

Скачать таблицу отчета 2