Я искал белок по названию своего организма Liquorilactobacillus hordei DSM 19519. По данному запросу удалось получить 2230 белка. Чтобы выбрать хорошо аннотированный белок, я выбрал соответсвующий фильтр лучшим показателем был annotation score:4. Таким образом получилось сократить количество белков до 9. Из них мне понравился ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH, так как в прошлых задания белок который я исследовал тоже зависел от цинка.
Название АТФ-зависимая цинк-металлопротеаза
Функция: Участвует в пострансляционной модификации цитоплазматических и мембранных белков. Играет роль в контроле качества интегральных мембранных белков.
(keyword:"Metalloprotease") AND ( keyword:"Zinc") AND (keyword:"Cell membrane") поиск белков со схожей функцией среди всех таксонов результатов: 146,155
(keyword:"Metalloprotease") AND ( keyword:"Zinc") AND (keyword:"Cell membrane") AND (reviewed:true) аннотированные белки из схожих результатов: 834
(keyword:Metalloprotease) AND (keyword:KW-0862) AND (keyword:"Cell membrane") AND (taxonomy_id:186826) количество сходных по функции белков среди Lactobacillales: 2,406
(keyword:Metalloprotease) AND (keyword:KW-0862) AND (keyword:"Cell membrane") AND (reviewed:true) AND (taxonomy_id:186826) аннотированных среди Lactobacillales: 63
Все белки Lactobacillales составляют 1,65% от всех белков с подобной функцией, но среди аннотированных процент 7,5 что выше. Отсюда можно предположить что такие белки в большей степени изучаются именно на Lactobacillales и возможно они важны для их жизнедейтельности.