Целью занятия было научиться строить глобальные выравнивания на основе алгоритмов Нидельмана-Вунша.
Мною были построены выравнивания последовательностей первых 4 аминокислот моего белка (как ни странно, они выглядят как MAKS) с изменённым вариантом – SAXIS. В файле
matrix.xls содержатся эти выравнивания, построенные с помощью формул Microsoft Excel. Оптимальным выравниванием оказалось приведённое на Таблице 1, с весом 0. Из наблюдений могу сказать что сделать это выравнивание вручную было бы, конечно, намного проще.