| Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
| Фрагмент последовательности | L-K-I-V-K-I-D-V-D-E-N | 1 | Нет. Найден только мой белок |
| Сильный | [ALV]-[KD]-[IV]-[CLV]-K-[VLIM]-[ND]-[TVI]-D-[ED]-[NQ] | 30 | Да. Найдены белки выравнивания и еще несколько. |
| Слабый | [LIVM]-X(1)-K-[VLIM]-[ND]-X(1)-D-[ED]-[QN] | 66 | Да. Найдены белки выравнивания и некоторые белки найденные в BLAST'е |
Все описанные в PROSITE мотивы в заданном белке THIO_BACSU
| Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
| PS51352 | THIOREDOXIN_2 | Профиль домена тиродоксина | Профиль | Ссылка на профиль | Cпецифична | 1 |
| PS00194 | THIOREDOXIN_1 | Активный сайт тиродоксина | Паттерн | [LIVMF] - [LIVMSTA] - x - [LIVMFYC] - [FYWSTHE] - x(2) - [FYWGTN] - C - [GATPLVE] - [PHYWSTA] - C - {I} - x - {A} - x(3) - [LIVMFYWT] | Специфична | 1 |
| PS00008 | MYRISTYL | Сайт N-миристоилирования | Паттерн | G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} | Неспецевична | 1 |
Вернуться на страничку 2 семестра