На главную страницу
Кристалл, группа симметрий, структурные факторы
Итак, сначала посмотрим как выглядит наша ячейка.
![](pic/2/cell.JPG)
Мы можем сказать, что наша ячейка не ортоганальна, и белок находится в центре ячейки.
Параметры ячейки найдем в pdb файле белка. Найдем строку CRYST1:
CRYST1 36.765 38.395 41.878 83.33 66.62 78.08 P 1 2
Из этой строки можем понять параметры ячейки:
Длины сторон ячейки:36.765 38.395 41.878
Углы между сторнами ячейки:83.33 66.62 78.08
Тип центрирования: P
Тип симметрии: 1
Кол-во мономеров в ячейке: 2
Посмотрим количество соседних молекул в этой ячейке. Воспользуемся функцией symexp.
![](pic/2/neib.JPG)
![](pic/2/neib2.JPG)
Получилось 10 соседей.(Можно посмотреть на картинках сверху, либо на список снизу).
![](pic/2/all.JPG)
Теперь скачаем файл структурных факторов, содержащий результаты рентгеноструктурного эксперимента.
Вот этот файл по моему белку(2voc-sf.cif)
Там есть строчка такого содержания:
_reflns.number_all 31147
Отсюда следует,что:
Структурных факторов-31147
А в таблтце можно найти данные по рефлексам:
Минимальная амплитуда рефлекса-14
Максимальная амплитуда рефлекса-1979,9
обратно
© Сливко-Кольчик