Из одной из баз данных был взят fasta-файл с геномом бактерии Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270. Оттуда с помощью команды seqret была выделена кодирующая последовательность белка сульфид-хинонредуктазы, затем с помощью программы transeq она была переведена в аминокислотную.

Для внесения мутаций были созданы файлы-копии кодирующей последовательности, а затем с помощью текстового редактора произведены указанные в задании замены и делеции. С помощью needle были построены выравнивания, демонстрирующие изменения, произошедшие в первичной структуре белка.

Ключевые изменения были занесены в таблицу, которую вы можете скачать по соответствующей ссылке. Изображения выравниваний (фрагментов выравниваний) вы можете скачать по этой ссылке*.

*Опущено изображение четвертого выравнивания, поскольку произведенная замена, как и первая, оказалась синонимичной.

Подводя итоги можно сказать, что даже небольшие инсерции, делеции, замены могут привести к глобальным изменениям в первичной структуре белка, сдвигу рамок считывания, разделению последовательности, замене аминокислотных остатков и другим явлениям. В то же время небольшие нуклеотидные замены могут никак не сказаться на строении белковой молекулы, также как и вставки или делеции, не влияющие на функциональные центры и укладку белка.