Практикум 1. Филогенетические деревья.

НомерНазвание
1STRP1
2BACSU
3CLOTE
4GEOKA
5LACDA
6LISMO
7STAAR
Таблица 1. Выбранные для построения дерева организмы

Скобочная формула исследуемого дерева: (((STRP1, LACDA),(STAAR, (LISMO,(GEOKA, BACSU)))), GLOTE);

1

Рисунок 1. Итоговое филогенетическое дерево

Нетривиальные ветви:

1. {STRP1, LACDA} VS {STAAR, LISMO, GEOKA, BACSU, GLOTE}

2. {STRP1, LACDA, GLOTE} VS {STAAR, LISMO, GEOKA, BACSU}

3. {GLOTE, STRP1, LACDA, STAAR} VS {LISMO, GEOKA, BACSU}

4. {GLOTE, STRP1, LACDA, STAAR, LISMO} VS {GEOKA, BACSU}

Практикум 2. Реконструкция филогении.

НомерНазвание
1Streptococcus pyogenes serotype M1cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Streptococcus; Streptococcus pyogenes
2Bacillus subtiliscellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus; Bacillus subtilis group
3Clostridium tetanicellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium
4Geobacillus kaustophiluscellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Geobacillus; Geobacillus thermoleovorans group
5Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricuscellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus; Lactobacillus delbrueckii
6Listeria monocytogenes serovar 1/2acellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Listeriaceae; Listeria; Listeria monocytogenes
7Staphylococcus aureuscellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Staphylococcaceae; Staphylococcus
Таблица 2. Выбранные для построения дерева организмы

В описанных выше тривиальных ветвях выделяются следующие таксоны: (1) - Lactobacillales; (2) - Bacialles; (4) - Bacillaceae