Magnetospirillum magneticum AMB-1

Информация о бактерии Magnetospirillum magneticum AMB-1

Magnetospirillum sp. Классификация организма:

Царство - Bacteria
Тип - Proteobacteria
Класс - Alphaproteobacteria
Порядок - Rhodospirillales
Семейство - Rhodospirillaceae
Род - Magnetospirillum

Эти бактерии характеризуются спиральной или винтообразной формой, а также способностью двигаться при помощи полярных жгутиков на каждом из концов клетки. Типичное местообитание Magnetospirillum — мелкие чистые водоёмы и донные осаждения с низким содержанием кислорода, необходимым им для роста. Поэтому они обитают в верхней части осаждений с предпочтительной для него концентрацией кислорода около 1—3 %. Вероятно, наиболее специфическое свойство Magnetospirillum — способность принимать определённое положение относительно магнитного поля Земли, то есть магнитотаксис. Это достигается за счёт присутствия в цитоплазме бактерии специальных органелл — магнетосом. Magnetospirillum также способен к аэротаксису, благодаря чему постоянно остаётся в среде с подходящей концентрацией кислорода. Когда бактерия усваивает железо, её белки взаимодействуют с ним, формируя крошечные кристаллики магнетита, самого сильного ферромагнетика среди минералов Земли.

В базе данных RefSec идентификатор Magnetospirillum magneticum AMB-1: NC_007626.
Длина генома этой бактерии - 4967148 п.н.
Число генов - 4613
Число генов кодирующих белки - 4561.

На рисунке 1 можно увидеть окружение гена белка YP_422030.1 в геноме бактерии. Информация о соседних генах приведена в таблице ниже рисунка. Более подробно ознакомиться с белком можно здесь.

Рисунок 1. Окружение гена белка YP_422030.1 в геноме бактерии

Соседними генами являются: со стороны 5'-конца - YP_422029.1; со стороны 3'-конца - YP_422031.1. У гена YP_422029.1 направление +1, расстояние до YP_422030.1: 1 п.н., рамка считывания относительно YP_422030.1: +2. Направление гена YP_422031.1 +1, расстояние до YP_422030.1: 116 п.н., рамка считывания относительно YP_422030.1: +2.
Так как все три гена имеют одно направление, то они все могут входить в один оперон. Ближайший ген на комплиментарной цепи со стороны 5'-конца находится на расстоянии 1 гена. С 3'-конца - 6 генов.