1. Укоренение в среднюю точку.
Дерево, укорененное в среднюю точку при помощи программы retree пакета PHYLIP
Укоренение произошло в ветвь {VIBFM, PROMH, YERPS, ECOLI, SALTY, ERWT9}-{BRADU, RHOS4}, что соответвует разделению на таксоны Gammaproteobacteria и Alphaproteobacteria.