В PDB была выбрана структура 5NUC, состоящая из двух цепей и построенная методом ЯМР (20 моделей).
Рис.1 Структура 5NUC
Для каждой модели были посчитаны площади молекулярной поверхности и поверхности, доступной для растворителя
Также был построен график зависимости площади поверхности, доступной для растворителя, от площади молекулярной поверхности. Хотя разброс значений немал, но можно наблюдать положительную зависимость.
Рис.2 График зависимости площади поверхности, доступной для растворителя, от площади молекулярной поверхности.
Также были построены поверхности в местах контактов цепей.
Рис.3 Поверхнсоти в местах контактов цепей.