На главную страницу первого семестра

Описание вторичной структуры дезоксирибозофосфатальдолазы




  На рисунке изображена схема вторичной структуры белка.
  Желтыми стрелками изображены β-тяжи (стрелка указывает
на C-конец белка); красными прямоугольниками - α-спирали.
Буквенная запись вторичной структуры:
H1(3-14)-S2(15-18)-H2(25-36)-S2(37-38)-S3(41-42)-S4(45-47)-
-H3(49-63)-S5(69-74)-H4(82-97)-S6(100-104)-H5(106-112)-
-H6(115-132)-S7(135-139)-H7(141-161)-S8(165-167)-H8(178-193)-
-S9(199-201)-H9(208-224)-S10(235-237)-H10(240-249).
  Тяжи S2 и S3 образуют антипараллельный β-слой,
остальные тяжи образуют что-то вроде бочки.
  Метод определения: изобразить белок в модели cartoon и раскраске
structure (в RasMol) и определять номера аминокислот, образующих
определенный элемент вторичной структуры. Для удобства можно
"расплетать" цепь с одного из концов, выстригая (restrict not ...)
уже определенные куски.
   

©Хайруллин Альберт